一般社団法人 日本船主協会（にほんせんしゅきょうかい、英文名称：The Japanese Shipowners' Association、略称：jsa）は、1947年6月に設立された100総トン以上の船舶の所有者、賃借人ならびに運航業者で日本国籍を有する者を会員とする業界団体。2009年（平成21年）3月1日現在109社で構成されており、公共の福祉のために海運業に関する諸般の調査および研究を行い、海運業の公正かつ自由な事業活動を促進し、日本海運の健全な発展に資することを目的とする団体である。

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