公益財団法人日本高等学校野球連盟（にほんこうとうがっこうやきゅうれんめい、英語表記：Japan High School Baseball Federation）は、日本の高校野球（男子）の統轄組織で、47都道府県の高等学校野球連盟が加盟している。公益財団法人全日本大学野球連盟とともに、上部組織として公益財団法人日本学生野球協会を構成している。略称は日本高野連（にほんこうやれん）または単に高野連（こうやれん）とも。戦前に大阪朝日新聞社によって実施されていた全国中等学校優勝野球大会を運営する目的で1946年に結成された全国中等学校野球連盟が母体となっている。第二次世界大戦終結によって、1947年に学制改革が実施され、中等学校が高等学校へ改組されると全国高等学校野球連盟と改称した。さらに1963年には文部省から財団法人として認可され、同時に名称を改称した。常任理事会と9の地区理事会で構成される全国理事会、評議員会、複数の委員会から構成。2012年時点では、規定で認めていない。しかし2008年、当時の渡海紀三朗文部科学大臣はアメリカでは女子選手も一緒にプレーしているという事例を挙げた上で女子の公式戦出場について検討または女子の練習参加を認めるべきとの認識を示した。なお、1995年には全国高等学校女子硬式野球連盟という組織が別に作られ、2012年時点で全国で6校が加盟、全国大会も行われている。学校法人芦屋学園は2014年度から中学・高校・大学一貫の硬式野球チーム「芦屋学園ベースボールクラブ」を創設して関西独立リーグの兵庫ブルーサンダーズ傘下の育成チームとして活動することになった。日本高校野球連盟に加盟しないため甲子園大会などの公式戦への参加や高野連加盟校の野球部との試合はできないが、社会人クラブチームや専門学校チームと「チャレンジリーグ」を創設する予定で、また、プロアマ規定の適用はなく実力があれば学年を問わず関西独立リーグの試合にも出場できるという。

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