〒181-0015　東京都三鷹市大沢三丁目10番30号小規模大学なので学生食堂がない。隣接する国際基督教大学、国際基督教大学高等学校、ルーテル学院大学の食堂を利用するか、あるいは学生ラウンジで持参の弁当を温めるなどして食べることになる。正門とは反対側の鬱蒼たる林の中に隣りの国際基督教大学へ通じる小径が通っている。この道は、国際基督教大学側から東京神学大学へ向かうとき「出家の道」、逆方向のときは「還俗の道」と冗談で呼ばれる。教師も学生も日曜日は教会で奉仕をするので、月曜日は選択科目が２コマあるだけである。チャペルでの学内礼拝は、火曜日から土曜日まで毎朝行われる。説教は、教授陣と学生がこれに当たるが、学外からのゲストを説教者に迎えることもある。パイプオルガンの奏楽も主として学生が奉仕する。学内礼拝は、教室における学びと並んでこの学校での生活の要である。通常最終学年である博士前期課程2年次の学生は、後期学期は牧会の現場に備えて「実践神学研修課程」に専念する。そのため、修士学位論文は9月中に提出する（審査・合否発表は年内に行われる）ので、多くの場合前期学期は論文指導・執筆が唯一の履修科目となる。いきおい、ほとんどの博士前期課程の単位は同1年次のうちに取得しておかなくてはならないことになる。

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