沿革については大学の公式サイトに詳しい。過去に後述の歯科医師国家試験問題の漏洩事件を起こし関係者の処分を受けた事があり、私立歯科大学の存在まで検討される大きな問題となった。現在は過去の事件を繰り返さないためにいくつかの施策を講じ、歯学教育の信頼回復に努めている。奥羽大学の平成16年度私立大学等経常費補助金は331,315,000円であり、補助金交付の額は502大学の中で196位となっている。また、2005年3月に国の認めた第三者機関による評価が大学に義務付けられたのを受け、財団法人・大学基準協会が評価結果を公表したが「歯科医師国家試験問題漏洩事件などで、学生の意欲低下を招いた」として、奥羽大学は合否判定保留になった。大学側は2007年6月末までに改めて合否判定を受ける方針である。その後、2007年6月末までに大学側から提出された改善報告書に基づく再評価結果が公表され、「意欲的に改善に取り組んでいることを確認できた」として、大学基準に適合していると認定された。

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