神宮寺駅（じんぐうじえき）は、秋田県大仙市神宮寺字本郷野にある、東日本旅客鉄道（JR東日本）奥羽本線の駅である。島式ホーム1面2線を持つ地上駅。指定券の取り扱いも行う。営業時間外は乗車証明書発行機から乗車証明書を取って車内精算する形となる。1番線側の線路は標準軌と狭軌が一緒の三線軌条方式となっている。角館側（駅舎から見て一番奥）が、秋田新幹線の通過線である。秋田新幹線の通過線の奥には本線とはつながっていない架線の張ってある線路があり、訓練等に使われる。2008年に駅舎改築を行い、新駅舎は大仙市の施設とJR東日本の施設の合築駅舎となった。大曲駅管理の簡易委託駅（大仙市委託、窓口営業時間:7時30分 - 16時30分）。路線バス（羽後交通）のバス停は駅から徒歩2分の神宮寺駅前角となる。

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