設置者・運営法人は、学校法人藤田学園。創立時には、名古屋保健衛生大学という大学名だったが、設立者である藤田啓介・藤田学園元総長（1925年3月21日-1995年6月11日、名古屋帝国大学医学部卒、元岩手医科大学助教授・元愛知学院大学歯学部教授）の名前および学園名に因んで命名された。建学の理念は「獨創一理」であり、あなた自身がもつ創造力で新しい時代を切り拓いていく力となり得る、という考え方を示したものである（2010年学校案内より）。1970年代に医学部が設置された新設私立医大であるがその研究レベルは高く、2003年に医学系分野で超低侵襲標的化診断治療開発センターとして21世紀COEプログラム研究教育拠点に採択された。研究で拠点リーダーは浅野喜造医学部小児科教授（1944年-、名古屋大学医学部卒）。また、2004年には、短期大学が文部科学省の「特色ある大学教育支援プログラム」に採択された。また最近ではアルツハイマーに関して、異常たんぱくが脳内でつくられる仕組みについて総合医科学研究所・前田明教授の研究グループが取り上げられている。医学部の6年間の学費は、3,700万円程度（）。名古屋大学医学部や慶應義塾大学医学部出身の教授が多いが、1999年以降は自校出身の教授も何人か誕生している。また、准教授以下の研究者には多くの自校出身者がいる。毎年10月下旬に、学園祭"Fujita Festival"が開催される。藤田学園独自のアセンブリが必須科目として取り入れられている。これは教職員と学生が学部・学校の壁を越えて共通の活動を行うことを通して、チーム医療に要求される能力と意識を養うものである（2010年度学校案内より）。46個のアセンブリ班から選択する。医療系単科大の特性上、担任制、学年制をとっており、クラス体系で同じ学科の人間と毎日同じ授業を受けることが多い。『1リットルの涙』の原作者・木藤亜也の主治医である山本紘子は、この大学の助教授を務めていた。第2教育病院である藤田保健衛生大学坂文種報徳會病院の元病院長である（2009年度学校案内より）。8時45分頃、大学病院内にメロディーが流れる。「太陽と大気と水」のマーク、略称プロミネンス・マークを古代風鏡の中に嵌入したものである。太陽と大気と水のあるところに「生命の起源」があり、生物の進化があり、人類の誕生があった。このマークは、生命の存在しうるところに、生命よ永遠なれとの敬虔な祈りの象徴である。それはまた、医の一切の指向を「生命の尊厳」を高く掲げる生命科学として、ライフ・サイエンス・マークとも言われる。鏡は、絶えず、自らを映して、ソクラテスの言葉「人よ、汝自らを知れ」の示唆である。約24.3万平方メートルある豊明校地には第1教育病院と医学部医学科、医療科学部がある。看護専門学校も同キャンパス内にある。創立者である藤田啓介の存命中に建てられた校舎の多くは、ベンゼン環をモデルとした6角形構造である。医学部3号館、看護専門学校、フジタホール2000、医療科学部8号館、医療科学部9号館で藤田学園合同校舎を構成している。日本一の一覧

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